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NDKmol - 分子構造ビューア
価格: 無料
market評価:
(評価数: 270) ダウンロード数: 10,000以上
■ 概要
NDKmol - 分子構造ビューア
== 概要 == NDKmol は Android 用の分子構造ビューアです。蛋白質や低分子の立体構造を表示できます。構造データは、RCSB PDB や NCBI PubChem から検索・ダウンロードできます。 NDKmol は WebGL/Javascript ベースの分子構造ビューアである GLmol とほぼ同等の機能を持っています。GLmol については http://webglmol.sourceforge.jp/index-ja.html をご覧ください。 == 機能 == 現在、以下の機能があります。他にも多くの機能が開発中です。 * PDB ファイルの読み込み * SDF/MOL ファイルの読み込み * RCSB PDB または NCBI PubChem から構造データを検索・ダウンロード * タッチ操作による分子の回転・平行移動・拡大縮小 * 各種表示方法 - 線 - 棒 - 球(ファンデルワールス半径) - 主鎖トレース - リボン - 寄り紐(ストランド) - 温度因子チューブ - 核酸 ラダー - 核酸 線 - 溶媒 * ベータシートの平滑化 * 各種着色 - 鎖ごと - 二次構造 (SHEET/HELIXレコードに記載がある場合) - 元素 - グラデーション - 温度因子 - 極性・非極性 * 結晶学 - 単位胞表示 - パッキングの表示 (REMARKセクションに記載がある場合) - 生物学的多量体(biological assembly)の表示 (REMARKセクションに記載がある場合) == 使用方法 == 起動すると自動的にポリン (PDBID: 2POR) を表示します。画面を指で触ることで回転できます。また、二本指によるピンチズームや移動にも対応しています。分子を拡大縮小したり移動するには、メニューボタンを押してモードを切り替えてください。 表示方法や色の切り替え、多量体やパッキングの表示など、全ての操作はメニューから行います。 他の PDB ファイルを読み込むには、PDBファイルを SDカード内の "PDB"フォルダに配置し、メニューの "Open" から読み込んでください。RCSB PDB や NCBI PubChem のサーバから直接構造を検索してダウンロードすることもできます。メニューから "検索してダウンロード" を選択してください。 == 連絡先 == プロジェクトのサイトは http://webglmol.sourceforge.jp/ です。ソースコードもここで配布しています。 ご意見・ご感想は、 http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ または biochem_fan@users.sourceforge.jp までお気軽にどうぞ。 === LICENSE notice === NDKmol itself is licensed under GNU Lesser General Public License as follows. However, PDB files included as examples are under DIFFERENT conditions. Please consult http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html (You must RENAME PDB files if you modified it!) ------------- NDKmol - Molecular Viewer for Android (C) Copyright 2011, biochem_fan This program is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version. This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License for more details. You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License along with this program. If not, see . ■ マーケットレビュー
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